Антигéн (англ. antigen от antibody generator — «производитель антител») — вещество, которое иммунная система распознает как чужеродное и даёт иммунный ответ. Антигеном могут служить макромолекулы (белки или их комплексы) извне или внутри организма. Так, антигенами могут быть части бактерий, вирусов, клеток растений (пыльца), животных, а также собственных клеток, клеток донорской крови и трансплантата.

Антигены трансплантата — это молекулы, которые находятся на поверхности клеток пересаженного органа. Они называются HLA (human leukocyte antigens). Именно на них реагирует иммунная система. А эту реакцию иммунной системы подавляют с помощью иммунодепрессантов.

Для определения антигенов HLA при трансплантации делают типирование.