Клинически значимое отторжение пересаженного органа проявляется нарушением его функции. Однако, причин для дисфункции трансплантата существует множество, и отторжение только одна из них. На данный момент нет принятых в клинической практике лабораторных или инструментальных методов, результаты которых позволили бы с достаточной чувствительностью и специфичностью установить диагноз отторжения трансплантата. Поэтому отторжение диагностируют при выполнении двух условий: 

1. исключение других причин дисфункции трансплантата
2. подтверждение отторжения по результатам патологоанатомического исследования фрагмента тканей трансплантата – биопсии.

Это означает, что при появлении признаков дисфункции трансплантата необходимо проведение обследования для выявления других патологий. В первую очередь исключают наиболее распространенные и острые причины поражения пересаженного органа наиболее простыми и быстрыми методами.  Если эти исследования не дают результата, проводится поиск менее острых и редких патологий, применяются более технически сложные или более инвазивные методы обследования.

Биопсия – это манипуляция, во время которой врач берет фрагмент ткани органа специальным инструментом. Она может быть пункционной (с помощью прокола иглой), инцизионной (отрезание скальпелем), щеточной и др. Для биопсии почки и печени используют иглу, биопсию легкого делают с помощью бронхоскопа (эндобронхиально), сердца – через сосуд (эндоваскулярно). Фрагмент ткани окрашивают специальными растворами и добавляют антитела со специальными метками, чтобы увидеть под микроскопом какие патологические клетки и молекулы есть в тканях. Интерпретация морфологической картины не всегда проста и требует высокой квалификации от специалиста-патоморфолога.

Например, у реципиентов почки при повышении креатинина или появлении протеинурии  рекомендуют проведение общего анализа мочи, бактериологического исследования мочи, анализов крови (общего, биохимического, вирусологического), УЗИ почечного трансплантата, при необходимости томографии или сцинтиграфии, исследования антиHLA- антител и биопсии трансплантата. Анализы и УЗИ  – это исследования, которые можно провести быстро и исключить хирургические, урологические и инфекционные осложнения. При их отсутствии показано проведение  биопсии. 

Однако, при остром отторжении и особенно при нарастающей дисфункции время начала лечения играет решающую роль для эффективного купирования аллоиммунной реакции. В этом случае диагноз отторжения ставят клинически и лечение может быть начато без биопсии или до получения результатов патологоанатомического исследования. Это решение опытный врач принимает на основании совокупности всех данных: анамнеза пациента и операции, посттрансплантационного срока, клинической картины и результатов лабораторной и инструментальной диагностики, взвешивая риски осложнений лечения и риски его отсутствия. 

При дисфункции трансплантата печени также применяют алгоритм обследования, с учетом распространенности различных причин дисфункции на разных сроках. Для определения этиологии проводятся анализы крови (общий, биохимический, вирусологический), УЗИ, томография, ангиография и биопсия. У реципиентов печени отторжение развивается реже, чем у реципиентов других органов и реже приводит к острой и тяжелой дисфункции и утрате трансплантата, поэтому перед назначением лечения отторжения чаще есть возможность провести морфологическую диагностику.

При дисфункции других трансплантированных органов существуют такие же алгоритмы, используя которые, устанавливают диагноз и назначают лечение.