Лекарственная лечение, необходимое при трансплантации, начинается еще на операционном столе. Кроме препаратов, необходимых для проведения наркоза, реципиенту вводят антибиотики и в момент реперфузии (восстановления кровотока) индукционную иммуносупрессию. В ее состав входит метилпреднизолон и препараты антител против лимфоцитов. В раннем послеоперационном периоде, при необходимости, вводятся их последующие дозы. В зависимости от выбранного врачом препарата, это может быть одно введение или несколько. 

Также в первые дни реципиент получает внутривенно противоинфекционную, антикоагулянтную профилактику, гастропротективную терапию и остальные необходимые лекарства.Первые таблетки, которые принимает реципиент это обычно такролимус или циклоспорин. Как только заканчивается необходимость во внутривенном введении, пациента переводят на прием внутрь тех препаратов у которых есть пероральные формы (капсулы, таблетки и др) и в таблетницу добавляется гастропротекция (ингибиторы протонной помпы), профилактика инфекций (нистатин или флуконазол, валганцикловир и ко-тримоксазол) и антиагрегант (ацетилсалициловая кислота). Кроме этого, в зависимости от  пересаженного органа, в назначениях появляются еще некоторые препараты, например, урсодезоксихолевая кислота у реципиентов печени необходима для хорошего оттока желчи.

Профилактическая терапия в раннем посттрансплантационном  периоде позволяет предупредить серьезные осложнения. Однако, в незнакомых препаратах можно легко запутаться. Избежать ошибок в приеме лекарств помогает следующее:

1. Мотивация. Нужно разобраться, для чего необходимо каждое лекарство. Понимание смысла назначенного лечения поможет обрести ощущение контроля и уверенности в правильности ваших действий.
2. Ориентированность в длительности приема. Некоторые препараты назначаются навсегда, другие принимают курсом или в течение короткого периода. Если упаковка лекарства закончилась, это не значит, что можно прекратить его принимать.
3. Ориентированность в дозировках. У некоторых лекарств есть разные дозировки, например, такролимус бывает 0,5 мг, 2 мг и 5 мг. При этом различия на упаковках могут не бросаться в глаза. Важно обращать внимание на дозировку, чтобы случайно не перепутать дозу.
4. Ориентированность в названиях. У всех лекарств есть МНН (Международное непатентованное название) и брендовое (коммерческое) название. Бренды иммунодепрессантов лучше часто не менять, в отношении остальных лекарств можно спокойно переходить с одного дженерика на другой.

Лекарственное обеспечение реципиентов иммунодепрессантами и жизненно-необходимыми лекарствами обеспечивается за счет средств государства. Выдаются лекарства по месту жительства на основании рекомендаций центра трансплантации. Важно следить, чтобы всегда был в наличии запас лекарств по крайней мере на несколько недель. Если после контроля анализов и приема врача дозировка увеличивается, нужно снова обратиться по месту жительства  для выдачи лекарств с новой справкой.